CLIQSシリーズ
一次元電気泳動ゲルからの系統樹解析(クラスター解析)ソフトウェア
1Dゲル画像からの系統樹解析を
誰でも簡単に行うことができるソフトウェアです
Totallab社のCLIQSシリーズ(旧Phoreteix 1D / TotalLab Quant)は、DGGEゲル、PFGEゲル、RFLPゲルなどからのレーン間バンドパターンマッチングと系統樹解析(クラスター解析)で定評のあるソフトウェアです。
CLIQS / CLIQS 1D Pro
-
- 環境中の微生物叢の解析、醸造・培養液中の微生物叢の解析、農作物の品種分析、集団遺伝学などで多用されるDGGEゲル、PFGEゲル、RFLPゲルなどから系統樹解析を行うことができます。
- ゲル内の系統樹解析(CLIQS)だけでなく、ゲル間の系統樹解析(CLIQS 1D Pro)も可能です。
- バンド濃度定量&分子量定量、コロニーカウントなど一般的な画像解析用途にも対応。
- 多くの画像形式に対応しています( .tiff、.gel、.jpg、bmp、.gif、.png、.img)。
対応アプリケーション例
- DNA フィンガープリンティング
- パルスフィールドゲル電気泳動(PFGE)
- 変性剤濃度勾配ゲル電気泳動(DGGE)
- 制限酵素断片長多型解析(RFLP)
- 腸内菌の反復性コンセンサス-PCR(ERIC-PCR)
- 1本鎖高次構造多型(SSCP)フィンガープリンティング
- 自動rRNA遺伝子間多型解析-PCR(ARISA-PCR)
- 増幅断片長多型解析(AFLP)
複雑な解析を誰でも簡単に
CLIQSソフトウェアの操作は極めて簡単、ガイドに従って解析を進めるだけで欲しい結果を簡単に手にしていただくことができます。
習熟に要する時間はほんのわずかで、すぐに結果を得ることができます。
レーン検出、バンド検出、バックグラウンド補正などは自動化されたアルゴリズムを使用することができ、系統樹作成もワンクリックです。もちろん、必要に応じて各種のパラメーターを修正することで、解析の正確性を高めていただくこともできます。
試用版ソフトウェアあるいはオンラインデモをご希望の方はこちら
ゲル内の系統樹解析にはCLIQS、ゲル間にはCLIQS 1D Pro
CLIQSシリーズには、CLIQSソフトウェアとCLIQS 1D Proソフトウェアの2種類がございます。
CLIQS(旧TotalLab Quant/Phoretix 1D)はゲル内の系統樹解析のみ、CLIQS 1D Pro(旧Phoretix 1D Pro)はゲル内だけでなくゲル間の系統樹解析にも対応しています。
CLIQS 1D Proにはデータベース機能もあるため、バンドパターンの類似度からUnknownサンプルの推定解析を行うこともできます。
CLIQS / CLIQS 1D Proで得られるデータについて知りたい方はこちら
豊富な論文実績
CLIQSシリーズ(旧Phoreteix 1D / TotalLab Quant)は、一次元電気泳動ゲルからの系統樹解析(クラスター解析)で非常に多くの論文に使用されている実績豊富なソフトウェアです。
下のボタンをクリックすると、CLIQSソフトウェアの旧名であるPhorteix 1DあるいはTotalLab Quantを含めた系統樹解析(クラスター解析)における論文例をGoogle Scholarで検索していただけます。
歪みのあるゲルでも解析可能!
レーンが歪んだ電気泳動ゲルの画像解析で苦労したことはありませんか?
バンドパターンマッチング解析では、正確なレーン検出とバンド検出が大切ですが、歪みの大きいゲルの解析は容易ではありません。
CLIQSソフトウェアでは、「高レベルの自動アルゴリズム」と「ユーザーによる補正」により、歪みの大きいゲルでも正確な解析が可能です。
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系統樹解析だけでなく様々な用途に対応
CLIQSソフトウェアは、バンドパターンマッチングと系統樹解析だけでなく、通常の一次元電気泳動解析やウェスタンブロット解析を含めて様々なアプリケーションに対応しています。
マルチプレックス画像解析
マルチカラー蛍光法で撮影したマルチプレックスウェスタンブロット画像(あるいはマルチプレックス電気泳動画像)の解析を簡単に実施できます。
- マルチカラー画像の合成(重ね合わせ)から解析まで簡便なワークフローで行っていただけます。
- ハウスキーピングタンパク質あるいは総タンパク質染色によるノーマライゼーションに対応。
21 CFR Part11(GxP)対応
CLIQSソフトウェアはレギュレーション環境下(GxP環境下)での使用したい製薬会社あるいはCRO/CMOのお客様のために21 CFR Part11対応モジュールをご用意しています。
バイオ医薬品の特性分析や品質管理で一次元電気泳動画像解析を行いたい方に最適なオプションです。
製品比較
ソフトウェア名 | CLIQS | CLIQS 1D Pro |
(旧 TotalLab Quant /Phoretix 1D) | (旧 Phoretix 1D Pro) | |
1Dゲル&ウェスタンブロット解析 | ||
---|---|---|
レーン検出&バンド検出(自動) | ○ | ○ |
レーン検出&バンド検出(マニュアル) | ○ | ○ |
マルチプレックス画像の解析 | ○ | ○ |
マルチタイター画像の解析 | ○ | ○ |
バックグラウンド補正 | ○ | ○ |
自動バンド検出 | ○ | ○ |
プロファイルデコンボリューション | ○ | ○ |
Rfキャリブレーション | ○ | ○ |
バンド分子量算出 | ○ | ○ |
バンド濃度(バンド量)算出 | ○ | ○ |
2Dイメージ表示 | ○ | ○ |
3Dイメージ表示 | ○ | ○ |
レーンプロファイル表示 | ○ | ○ |
数値データのテーブル表示 | ○ | ○ |
系統樹解析 | ||
バンドパターンマッチング(ゲル内) | ○ | ○ |
バンドパターンマッチング(ゲル間) | ○ | |
系統樹解析(ゲル内) | ○ | ○ |
系統樹解析(ゲル間) | ○ | |
データベースライブラリーの作成 | ○ | |
データベースライブラリーとの比較 | ○ | |
レーン類似度の表示 | ○ | ○ |
その他の機能 | ||
アレイ解析モジュール | ○ | ○ |
コロニーカウンティングモジュール | ○ | ○ |
イメージ解析ツールボックス | ○ | ○ |
21 CFR part11対応 | オプション |
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