次世代シーケンサー
AVITI システム
次世代シーケンス（NGS）に新たなブレークスルーを
圧倒的なシーケンス精度を誇る新時代の次世代シーケンサー
Element社のAVITIシステムは、研究者ニーズを最優先に考え、シーケンシングのあらゆる側面を見直し、再設計した新しいNGSです。
この新たなNGSは、多くの研究者にとって使いやすいショートリードペアエンドシーケンスのミドルスループットNGSとして設計され、同等スループットとして標準的なランニングコストで、業界トップクラスの高精度なシーケンシング結果を提供します。
さらに、TetomTMテクノロジーによりフローセル上にロードした最大100万細胞をシングルセルレベルでのマルチオミクスな解析を可能とします。
AVITIシステムの使用により、研究者の皆様がより短時間でより多くの発見を実現できることが期待されます。
高精度を支える独自のケミストリー
シーケンシングテクノロジー
最も一般的なショートリードNGSにおいても、インデックスのデザインやライブラリ調製の最適化、データ解析時におけるフィルタリングツールの使用などにより、エラーをできるだけ排除する様々な工夫がありますが、AVITIシリーズではPCRを行わない、独自に開発したAvidity Base Chemistry（ABC）テクノロジーをシーケンシングに用いることで、化学的に低エラーとなりえるシーケンシングを実現しました。
Avidity Base Chemistry（ABC）テクノロジーは、一本鎖ライブラリーをフローセル上でキャプチャーし、環状化させた後、ローリングサークル増幅を行い、単一テンプレートから形成されたオリゴ鎖（ポロニー）を形成します。
このテクノロジーにより、PCRでは容易に起こり得るエラーの蓄積が低減されます。さらにライブラリーの塩基配列を正確に検出するためA,T,G,Cそれぞれに対応した4色の蛍光色素を用いることで光学的な重複を削減します。これらの一連のABCテクノロジーがシーケンスの精度を飛躍的に向上させます。
注目のアプリケーション
Q50レベルの超高精度シーケンシング ーCloudbreak Ultra Qー
Element社では、低頻度・レアな配列を確実に検出するため高精度のQ50レベルのシーケンスデータが得られるシーケンスキット Cloudbreak UltraQをご用意しております。Cloudbreak UltaraQキットのご利用には、専用のライブラリ調製キットが必要となります。
※右図：Cloudbreak Ultra Qキットでは、300サイクル全体を通してQ50前後のクオリティーを維持していることが⽰されました。
ライブラリ調製はそのままにAVITIの高精度シーケンシングを ーCloudbreak Freestyleー
これまでご利用されていた他社製のライブラリ調製キットで作製されたライブラリでも、Avidity Base Chemistry（ABC）テクノロジーによる高精度なシーケンシング（>90% >Q30）を可能とするシーケンシングキット Cloudbreak Freestyleをご用意しております。
※右図：同⼀サンプルをCloudbreak Freestyleキット(⻘)と他社製品(緑)を使⽤し300サイクルシーケンスにて⽐較したデータです。Cloudbreak Freestyleキットでは、300サイクル全体を通してQ40前後のクオリティーを維持していることが⽰されました。
細胞プロファイリング
Element Biosciences社は2024年にTetonTMテクノロジーによりフローセル上にロードされた数十〜百万の細胞に対し、シングルセルレベルで、細胞形態、RNA発現、タンパク質とリン酸化タンパク質、in vitro DNAシーケンシングをたった一つの装置（AVITI24）で可能とする技術を公開しました。
この技術によりこれまで複数の高額な装置を組合せて行っていた実験がたった一つの装置で可能となるため、コスト削減の効果みならず、統合されたシームレスなデータの取得による新たな発見が得られることが期待されます。
（注意）細胞プロファイリングに試薬・キットは現在販売されておりません。
柔軟な操作性
デュアルフローセル
AVITIシステムは2枚のフローセルを別々に使用できるデュアルフローセル方式を採用しており、1台の装置でありながら2台の装置のように運用できます。ミドルスループットであることとデュアルフローセル方式の採用により、今ほしいデータに最短でアクセスすることができます。もちろん、2枚のフローセルを同時に動かし、2倍の出力のデータを得ることも可能です。
フローセルのレーンを別々に利用
さらには装置アップグレードにより、2レーンで構成される1枚のフローセルに1レーンずつ別々のライブラリ/プールをロードして、別々に解析することも可能です。
これによりインデックスの組合せを気にすることなく、またライブラリ調製キットのち外野ライブラリのクオリティの違いによる影響を避けてシーケンスすることができ、マルチプレキシング機能・スループットに対する柔軟性・プール内のリード分布のコントロールが向上します（2x300サイクルキットは非対応）。
装置
AVITI LT |
AVITI |
AVITI24 |
 |
 |
 |
| AVITI LTは、低スループット版のAVITIで、低コストの機器により高品質のABCシーケンシングをより多くのユーザーに提供します。AVITI LTは、小規模なプロジェクトやアプリケーションの範囲が限られている、あるいは設備予算が限られている研究室にとって理想的な選択肢です。AVITI LTは、フルスループットのAVITIまたはAVITI24のマルチオミクス機能にアップグレードする柔軟性を持ちながら、高品質のシーケンシングを提供します。 | AVITIシステムは、幅広いアプリケーションにわたって高品質のシーケンシングをバッチ処理の手間なく実施します。1億リードでも20億リードでも、AVITIは柔軟なスループットをリーズナブルなコストで提供し、パフォーマンスを損なうことなく時間とリソースを節約します。AVITIは、AVITI24のマルチオミクス機能にアップグレードすることができます。 | AVITI24は最先端のシーケンシング技術とTeton™を用いたCytoProfilingをシームレスに統合することで、科学的探査の新時代をもたらす装置です。AVITI24 Tetonを使用すると、単一のサンプルからDNA、RNA、タンパク質、リン酸化タンパク質、細胞形態をシングルセルの分解能で同時に解析することができます。 |
試薬
| 製品番号 | 品名 | 備考 | 対応機種 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Cloudbreak UltraQキット | リード数 | クオリティースコア |
他社 ライブラリ |
AVITI-LT | AVITI | AVITI24 | |
| 860-00018 |
AVITI 2x150 Sequencing Kit CB UltraQ |
8億リード （240 Gb） |
>70% Q50 >90% Q40 |
〇 | 〇 | ||
| Cloudbreak Freestyle キット | リード数 | クオリティースコア |
他社 ライブラリ |
AVITI-LT | AVITI | AVITI24 | |
| 860-00015 |
AVITI 2x75 Sequencing Kit Cloudbreak FS High Output |
10億リード （150 Gb） |
>90% Q30 | 〇 | 〇 | 〇 | |
| 860-00014 |
AVITI 2x75 Sequencing Kit Cloudbreak FS Medium Output |
5億リード （75 Gb） |
>90% Q30 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 |
| 860-00013 |
AVITI 2x150 Sequencing Kit Cloudbreak FS High Output |
10億リード （300 Gb） |
>90% Q30 | 〇 | 〇 | 〇 | |
| 860-00012 |
AVITI 2x150 Sequencing Kit Cloudbreak FS Medium Output |
5億リード （150 Gb） |
>90% Q30 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 |
| 860-00011 |
AVITI 2x150 Sequencing Kit Cloudbreak FS Low Output |
2.5億リード （75 Gb） |
>90% Q30 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 |
| 860-00017 |
AVITI 2x300 Sequencing Kit Cloudbreak FS High Output |
3億リード （180 Gb） |
>85% Q30 | 〇 | 〇 | 〇 | |
| 860-00016 |
AVITI 2x300 Sequencing Kit Cloudbreak FS Medium Output |
1億リード （60 Gb） |
>90% Q30 | 〇 | 〇 | 〇 | 〇 |
| Cloudbreak キット | リード数 | クオリティースコア |
他社 ライブラリ |
AVITI-LT | AVITI | AVITI24 | |
| 860-00004 |
AVITI 2x75 Sequencing Kit Cloudbreak High Output |
10億リード （150 Gb） |
>90% Q30 | 〇 | 〇 | ||
| 860-00007 |
AVITI 2x75 Sequencing Kit Cloudbreak Medium Output |
5億リード （75 Gb) |
>90% Q30 | 〇 | 〇 | 〇 | |
| 860-00003 |
AVITI 2x150 Sequencing Kit Cloudbreak High Output |
10億リード （300 Gb） |
>90% Q30 | 〇 | 〇 | ||
| 860-00006 |
AVITI 2x150 Sequencing Kit Cloudbreak Medium Output |
5億リード （150 Gb） |
>90% Q30 | 〇 | 〇 | 〇 | |
| 860-00005 |
AVITI 2x150 Sequencing Kit Cloudbreak Low Output |
2.5億リード （75 Gb） |
>90% Q30 | 〇 | 〇 | 〇 | |
| 860-00008 |
AVITI 2x300 Sequencing Kit Cloudbreak High Output |
3億リード （180 Gb） |
>85% Q30 | 〇 | 〇 | ||
| 860-00009 |
AVITI 2x300 Sequencing Kit Cloudbreak Medium Output |
1億リード （60 Gb） |
>90% Q30 | 〇 | 〇 | 〇 | |
| Spike-in コントロール | |||||||
| 830-00023 |
Cloudbreak FS PhiX Control 3rd Party |
他社製ライブラリーキット 使用時のコントロール |
〇 | 〇 | 〇 | 〇 | |
| 830-00017 |
Cloudbreak PhiX Control Library levate |
Element社 Elevateキット 使用時のコントロール |
〇 | 〇 | 〇 | ||
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