シングルセル解析に最適な自動細胞分散装置
Singulator 100

Singulator 100：資料ダウンロード

自動細胞分散装置 Singulator 100のカタログ等の資料ダウンロードページです。

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カタログ

Singulator 100 フライヤー
（日本語）

Singulator 100 Brochure
（英語）

Singulator 100 Nuclei Data Sheet
（英語）

テクニカルノート

核カートリッジを用いた20 mg 以下の微量組織サンプルからの核抽出

Singulator 100は、新鮮組織、凍結組織、OCT包埋組織など様々な組織から迅速かつ効率的に細胞核を単離することができます。単離した核サンプルは、シングルセルRNA-Seq、ATAC-Seq、CITE-SeqなどからFACSまで広範なアプリケーションに応用できます。S2 Genomics社は、この核単離のための試薬と組織の種類ごとにカスタマイズ可能なプロトコルを提供し、マウス組織、ラット組織、あるいは腫瘍を含むヒト組織からの効率的な核抽出を可能にしています。新たに作られた核単離用のカートリッジを用いることで1 mgの微量組織からでも核の抽出が可能になりました。

本テクニカルノートでは、20 mg 以下の組織からの核単離の例をご紹介しています。

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RNAの分解を防ぐためのRNaseの使用

 Singulator 100は、新鮮組織、凍結組織、OCT包埋組織など様々な組織から迅速かつ効率的に細胞核を単離することができます。単離した核をシングルセルRNA解析などのRNA解析に用いるにあたっては、内在性のRNase（特にRNase A）によるRNAの分解を防ぐことが極めて大切です。RNaseによるRNAの分解を防ぎそのインテグリティを保つためには、核の単離と精製の工程にRNase阻害剤を加えます。

本テクニカルノートでは、Singulator 100による核単離ワークフローにおけるRNase阻害剤の使用について述べています。

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Singulator 100とMARSによる様々な組織からの効率的な核単離

Applied Cells社のMARS accoustic technologyは、独自の流体力学を用いて、物理学的な違いによりシングルセルやシングル核をラベルフリーで分離できるテクノロジーです。細胞は高い回収率で回収されシングルセルゲノミクス解析にすぐに用いることができます。Singulator 100は、固形組織サンプルからの細胞分散液あるいは核分散液の調製を、小さい組織からでも自動で効率的に行います。

本テクニカルノートでは、Singulator 100とMARSシステムの組み合わせによる効率的なシングル核単離法について解説しています。

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プレゼンテーション

• Automated Solid Tissue Dissociation for Single Cell ‘Omics Analyses
  – Markets and Markets 2021 Single Cell Analysis Conference

ポスター

• Nuclei Isolation from Immature Embryos of Wild Sorghum purpureosericeum with the Singulator™ 100 system 
  – PAG30
• Automated processing of solid tissues into single cells or nuclei for genomics and cell biology applications with the Singulator™ 100 and 200 systems
  – AGBT 2022
• Automated Processing of Solid Tissues into Single Cells or Nuclei with the Singulator™ 100 system: scRNA-Seq, and ATAC-Seq Data on Human and Mouse Tissues
  – AGBT 2022
• Improving Single Cell Workflows Using the Singulator 100
  – Michael Peterson, Allison Scott, Cathleen Lake, Lu Deng, Anoja Perera, The Stowers Institute for Medical Research
• Automated Dissociation of Solid Tissue Into Cells or Nuclei for Single Cell Analysis
  – Keystone Single Cell Conference 2021
• Automated processing of solid tissues into single cells or nuclei for sequencing
  – AGBT 2020

論文例

• The COVID Tissue Atlas Consortium, et. al. 
  Comprehensive characterization of the transcriptional response to COVID-19 in multiple organs reveals shared signatures across tissues.  
  doi:  https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.05.31.493925v1
• Zhang, H. et al.
  Application of high-throughput, high-depth, targeted single-nucleus DNA sequencing in pancreatic cancer.  
  doi:  https://doi.org/10.1101/2022.03.06.483206
• Becker, W.R., Nevins S.A. et al.  
  Single-cell analyses reveal a continuum of cell state and composition changes in the malignant transformation of polyps to colorectal cancer. 
  doi:  https://doi.org/10.1101/2021.03.24.436532
• Perez K. et al. 
  Single nuclei profiling identifies cell specific markers of skeletal muscle aging, sarcopenia and senescence.  
  BMJ, Preprint, doi:  https://doi.org/10.1101/2021.01.22.21250336
• Khazaei et al.
  Single substitution in H3.3G34 alters DNMT3A recruitment to cause progressive neurodegeneration.
  Cell, doi:  https://doi.org/10.1016/j.cell.2023.02.023
• Selin J. et al. 
  K27M in canonical and noncanonical H3 variants occurs in distinct oligodendroglial cell lineages in brain midline gliomas.
  Nature, doi:  https://doi.org/10.1038/s41588-022-01205-w